MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 69831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017341	TAT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860683
2	NC_017341	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860683
3	NC_017341	TGT	2	6	201	206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860683
4	NC_017341	TAC	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860683
5	NC_017341	GAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
6	NC_017341	TAA	2	6	261	266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860683
7	NC_017341	CAA	2	6	290	295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860683
8	NC_017341	AAC	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860683
9	NC_017341	AG	3	6	337	342	50 %	0 %	50 %	0 %	384860683
10	NC_017341	ATT	2	6	453	458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860683
11	NC_017341	ATGC	2	8	496	503	25 %	25 %	25 %	25 %	384860683
12	NC_017341	TCA	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860683
13	NC_017341	ATA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860683
14	NC_017341	TTA	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860683
15	NC_017341	TTA	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860683
16	NC_017341	GAT	2	6	655	660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860683
17	NC_017341	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
18	NC_017341	AGA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
19	NC_017341	TTG	2	6	824	829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860683
20	NC_017341	CCA	2	6	838	843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384860683
21	NC_017341	AGA	2	6	872	877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
22	NC_017341	GAA	3	9	883	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
23	NC_017341	CCA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384860683
24	NC_017341	TA	3	6	922	927	50 %	50 %	0 %	0 %	384860683
25	NC_017341	CAAAT	2	10	929	938	60 %	20 %	0 %	20 %	384860683
26	NC_017341	ATT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860683
27	NC_017341	CTG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860683
28	NC_017341	A	6	6	1094	1099	100 %	0 %	0 %	0 %	384860683
29	NC_017341	A	7	7	1143	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	384860683
30	NC_017341	AG	3	6	1198	1203	50 %	0 %	50 %	0 %	384860683
31	NC_017341	GAA	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
32	NC_017341	TGG	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860683
33	NC_017341	TCAT	2	8	1265	1272	25 %	50 %	0 %	25 %	384860683
34	NC_017341	A	6	6	1280	1285	100 %	0 %	0 %	0 %	384860683
35	NC_017341	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
36	NC_017341	AAG	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860683
37	NC_017341	TA	3	6	1391	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017341	TAA	3	9	1404	1412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017341	T	6	6	1419	1424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017341	CCA	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017341	CTA	3	9	1572	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017341	TA	3	6	1600	1605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017341	TA	4	8	1608	1615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017341	TAAT	2	8	1634	1641	50 %	50 %	0 %	0 %	384860684
45	NC_017341	ATT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860684
46	NC_017341	TTA	2	6	1671	1676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860684
47	NC_017341	AAC	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860684
48	NC_017341	AGT	2	6	1864	1869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860684
49	NC_017341	TTG	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860684
50	NC_017341	A	7	7	1900	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	384860684
51	NC_017341	ATTA	2	8	1954	1961	50 %	50 %	0 %	0 %	384860684
52	NC_017341	AATTT	2	10	1977	1986	40 %	60 %	0 %	0 %	384860684
53	NC_017341	TTA	2	6	2015	2020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860684
54	NC_017341	CAATT	2	10	2043	2052	40 %	40 %	0 %	20 %	384860684
55	NC_017341	GACT	2	8	2176	2183	25 %	25 %	25 %	25 %	384860684
56	NC_017341	AGA	2	6	2215	2220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860684
57	NC_017341	TCA	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860684
58	NC_017341	TAAA	2	8	2271	2278	75 %	25 %	0 %	0 %	384860684
59	NC_017341	GAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860684
60	NC_017341	TCT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860684
61	NC_017341	TTTA	2	8	2332	2339	25 %	75 %	0 %	0 %	384860684
62	NC_017341	ATT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860684
63	NC_017341	ACA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860684
64	NC_017341	AAATT	2	10	2421	2430	60 %	40 %	0 %	0 %	384860684
65	NC_017341	TTA	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860684
66	NC_017341	GGT	2	6	2492	2497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860684
67	NC_017341	TTA	2	6	2505	2510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860684
68	NC_017341	TGA	2	6	2524	2529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860684
69	NC_017341	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860684
70	NC_017341	TCT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860684
71	NC_017341	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860684
72	NC_017341	GGT	2	6	2603	2608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860684
73	NC_017341	TTCA	2	8	2620	2627	25 %	50 %	0 %	25 %	384860684
74	NC_017341	AT	3	6	2635	2640	50 %	50 %	0 %	0 %	384860684
75	NC_017341	GATG	2	8	2641	2648	25 %	25 %	50 %	0 %	384860684
76	NC_017341	ATG	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860684
77	NC_017341	GTTGAA	2	12	2675	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860684
78	NC_017341	TTC	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860684
79	NC_017341	GAC	2	6	2729	2734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860684
80	NC_017341	AATT	2	8	2745	2752	50 %	50 %	0 %	0 %	384860684
81	NC_017341	ATAAAT	2	12	2776	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017341	ATTA	2	8	2801	2808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017341	T	6	6	2824	2829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017341	AAT	2	6	2836	2841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017341	AAAT	2	8	2858	2865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017341	TAA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017341	A	6	6	3021	3026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017341	A	6	6	3047	3052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017341	AATT	2	8	3057	3064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017341	A	7	7	3113	3119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017341	AT	3	6	3126	3131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017341	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017341	AAG	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860685
94	NC_017341	GTA	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860685
95	NC_017341	ATT	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860685
96	NC_017341	TGG	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860685
97	NC_017341	ATTA	2	8	3276	3283	50 %	50 %	0 %	0 %	384860685
98	NC_017341	TTCT	2	8	3366	3373	0 %	75 %	0 %	25 %	384860685
99	NC_017341	TCAT	2	8	3377	3384	25 %	50 %	0 %	25 %	384860685
100	NC_017341	ATG	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860686
101	NC_017341	A	6	6	3660	3665	100 %	0 %	0 %	0 %	384860686
102	NC_017341	GTC	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860686
103	NC_017341	AT	3	6	3713	3718	50 %	50 %	0 %	0 %	384860686
104	NC_017341	AGA	2	6	3749	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860686
105	NC_017341	CTC	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384860686
106	NC_017341	GAC	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384860686
107	NC_017341	CTG	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860686
108	NC_017341	AAT	2	6	3876	3881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860686
109	NC_017341	A	7	7	3907	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	384860686
110	NC_017341	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860686
111	NC_017341	ATT	2	6	4066	4071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860686
112	NC_017341	GAA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860686
113	NC_017341	ATA	2	6	4144	4149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860686
114	NC_017341	GAT	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860686
115	NC_017341	TTA	3	9	4332	4340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860686
116	NC_017341	GAT	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860686
117	NC_017341	TTA	2	6	4383	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860686
118	NC_017341	ACA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860687
119	NC_017341	GTAT	2	8	4615	4622	25 %	50 %	25 %	0 %	384860687
120	NC_017341	AG	4	8	4637	4644	50 %	0 %	50 %	0 %	384860687
121	NC_017341	ATA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384860687
122	NC_017341	CAAAT	2	10	4708	4717	60 %	20 %	0 %	20 %	384860687
123	NC_017341	GTT	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860687
124	NC_017341	A	6	6	4792	4797	100 %	0 %	0 %	0 %	384860687
125	NC_017341	TGG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860687
126	NC_017341	CGG	2	6	4853	4858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384860687
127	NC_017341	TGG	2	6	4877	4882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860687
128	NC_017341	TCA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860687
129	NC_017341	TA	3	6	4958	4963	50 %	50 %	0 %	0 %	384860687
130	NC_017341	TCA	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860687
131	NC_017341	A	6	6	4977	4982	100 %	0 %	0 %	0 %	384860687
132	NC_017341	AAG	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860687
133	NC_017341	AG	3	6	5115	5120	50 %	0 %	50 %	0 %	384860687
134	NC_017341	TGA	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860687
135	NC_017341	AGA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860687
136	NC_017341	ATG	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860687
137	NC_017341	TCA	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860687
138	NC_017341	GAT	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860687
139	NC_017341	TACG	2	8	5372	5379	25 %	25 %	25 %	25 %	384860687
140	NC_017341	GGT	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384860687
141	NC_017341	AGA	2	6	5462	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860687
142	NC_017341	TATC	2	8	5518	5525	25 %	50 %	0 %	25 %	384860687
143	NC_017341	ATT	2	6	5603	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860687
144	NC_017341	TAT	2	6	5675	5680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860687
145	NC_017341	GGC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384860687
146	NC_017341	TGC	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384860687
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149	NC_017341	GAA	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860687
150	NC_017341	G	6	6	5835	5840	0 %	0 %	100 %	0 %	384860687
151	NC_017341	TAGA	2	8	5923	5930	50 %	25 %	25 %	0 %	384860687
152	NC_017341	TGGA	2	8	6049	6056	25 %	25 %	50 %	0 %	384860687
153	NC_017341	TTA	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860687
154	NC_017341	TTC	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384860687
155	NC_017341	TAT	2	6	6177	6182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384860687
156	NC_017341	TGAAT	2	10	6218	6227	40 %	40 %	20 %	0 %	384860687
157	NC_017341	AATG	2	8	6272	6279	50 %	25 %	25 %	0 %	384860687
158	NC_017341	ACA	2	6	6297	6302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860687
159	NC_017341	AGA	2	6	6416	6421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860687
160	NC_017341	TGAAC	2	10	6459	6468	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_017341	AGG	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017341	TCAA	2	8	6503	6510	50 %	25 %	0 %	25 %	384860688
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165	NC_017341	TATC	2	8	6739	6746	25 %	50 %	0 %	25 %	384860688
166	NC_017341	GTTATC	2	12	6781	6792	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384860688
167	NC_017341	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860688
168	NC_017341	ATGG	2	8	6825	6832	25 %	25 %	50 %	0 %	384860688
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171	NC_017341	ATG	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860688
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173	NC_017341	GGTA	2	8	7016	7023	25 %	25 %	50 %	0 %	384860688
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178	NC_017341	GAA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384860688
179	NC_017341	TTG	2	6	7264	7269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384860688
180	NC_017341	A	6	6	7312	7317	100 %	0 %	0 %	0 %	384860688
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234	NC_017341	CTATA	2	10	9209	9218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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240	NC_017341	T	6	6	9501	9506	0 %	100 %	0 %	0 %	384860689
241	NC_017341	ACA	2	6	9511	9516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384860689
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251	NC_017341	TAT	2	6	10128	10133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017341	ATT	3	9	10148	10156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017341	ATT	2	6	10214	10219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_017341	ACA	2	6	10230	10235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_017341	ATA	2	6	10273	10278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017341	AAG	2	6	10333	10338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017341	AT	3	6	10371	10376	50 %	50 %	0 %	0 %	384860690
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268	NC_017341	T	6	6	10744	10749	0 %	100 %	0 %	0 %	384860690
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270	NC_017341	CT	3	6	10788	10793	0 %	50 %	0 %	50 %	384860690
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402	NC_017341	GAT	2	6	16393	16398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384860694
403	NC_017341	ATC	2	6	16430	16435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384860694
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